Учрежден по указу 1724 г. и Положению об управлении губерниями 1775 г.

Выполнял административно-хозяйственные, полицейские, налоговые и судебные функции.

Упразднен по указу Сената от 13 апреля 1866 г. с передачей функций в уездный суд и городскую думу.

Указы вологодского губернского правления о взимании оброка и питейных сборов.

Журналы заседаний, протоколы указов магистрата по рекрутским наборам, уголовным и гражданским делам.

Книги записи доверительных и заемных писем, векселей по обязательствам, поручительств и протестов по векселям, контрактов, договоров и условий, заемных писем, духовных завещаний купцов и мещан. Описи имущества и приданного. Разбор прошений о разделе имущества, взыскании денег. Протоколы о выборах купцов и мещан на общественные должности. Списки чиновников и данные об их службе.

Отчеты по сбору пошлин с промыслов.

Судебное дело о смерти купца 3-й гильдии О. С. Лыткина (1850 г.). Следствие о пожаре, во время которого сгорел архив магистрата (февраль 1812 г.).