Армия сформирована приказом Верховного правителя и Верховного главнокомандующего N 158 от 14 июля 1919 г. Штаб армии формировался из штаба Северной группы войск Сибирской армии. В состав армии вошли: 1 Средне-Сибирский корпус, 7 и 16 Сибирские сд, 15 Воткинская сд, 17 Сибирская сбр, отряд полковника Бордзиловского, штурмовая и егерская бригады бывшей Северной группы войск Сибирской армии (приказы главнокомандующего Восточным фронтом N 17 и 18 от 22 июля 1919 г.). В сентябре 1919 г. из состава армии выбыли 7 Сибирская и 15 Воткинская сд, а в ее состав из 2 армии была передана 1 кавалерийская дивизия.

После поражения под Омском в ходе Омской операции Красной Армии (4 - 16 ноября 1919 г.) армия была отведена на переформирование в г. Томск. По приказанию главнокомандующего Восточным фронтом N 7632/оп от 8 ноября 1919 г. в тыл на пополнение были отправлены 1 и 2 Сибирские сд, штурмовая и егерская бригады. Приказом войскам 1 Сибирской армии N 046 от 18 ноября 1919 г. в ее составе начали формироваться 3 и 4 Сибирские егерские добровольческие дивизии. Войска армии сводились в два корпуса: 1 Средне-Сибирский армейский (1 и 2 Сибирские сд) и 2 Сибирский егерский (3 и 4 Сибирские егерские дивизии).

С занятием 20 декабря 1919 г. частями Красной Армии г. Томска большая часть 1 Сибирской армии была взята в плен, ее остатки вместе с войсками Восточного фронта отступили за Байкал.

Приказом командующего войсками Российской восточной окраины N 22 от 11 марта 1920 г. из остатков 1 армии был сформирован Сибирский партизанский отряд под командованием генерала Пепеляева.

Командующий армией: генерал-лейтенант Пепеляев Анатолий Николаевич.

Начальник штаба: Генерального штаба подполковник Кононов Константин Лукич.

Место дислокации штаба: гг. Тура, Ишим, Томск, Ново-Николаевск.

Приказы, приказания и объявления войскам армии, по управлению заведующего инженерной частью армии, по воздушному флоту армии административно-строевые (апр. 1919 - февр. 1920).

Оперативные и разведывательные сводки штабов армии и ее частей (май - нояб. 1919).

Доклад военно-полевого контролера армии об инспектировании управления Иркутского уездного воинского начальника (дек. 1919).

Записи разговоров по прямому проводу начальника воздушного флота главковерха с начальником воздушного флота и начальником штаба армии о формировании, укомплектовании, передислокации и деятельности авиачастей (июль - дек. 1919). Донесения командиров авиаотрядов о результатах полетов, переписка с авиачастями о их переподчинении и передислокации, списки авиачастей армии (май - дек. 1919).