Управление образовано на основании решения Алтайского крайисполкома N 507 от 26 августа 1965 г., выделив его из управления сельского хозяйства Горно-Алтайского облисполкома для обеспечения строительства и эксплуатации оросительных систем. Ликвидировано в 1985 г.

Приказы Министерства мелиорации и водного хозяйства РСФСР, управления мелиорации и водного хозяйства Алтайского крайисполкома, Горно-Алтайского управления оросительных систем, постановления, решения, распоряжения Алтайского крайисполкома, бюро ОК КПСС и Горно-Алтайского облисполкома, райисполкомов; планы работы управления, мелиоративных и культуртехнических работ по колхозам и совхозам области, проведения проектно-изыскательских работ в колхозах и совхозах, эксплуатационных мероприятий управления оросительных систем, мероприятий по орошению и обводнению в районах, производственно-финансовые планы и планы по труду; отчеты о мелиорации земель в колхозах и совхозах, технические отчеты управления по эксплуатационным мероприятиям, докладные записки, справки о состоянии орошаемых земель, оросительных систем, по обследованию и использованию орошаемых систем, строительству водохранилища на озере Манжерок, бланки-анкеты оросительных систем Кош-Агачского аймака (1937 - 1939 гг.), паспорта внутрихозяйственных систем; сметы и штатные расписания, годовые бухгалтерские отчеты управления, статотчеты по кадрам, материалы о награждении рабочих и служащих управления, протоколы заседаний, сметы расходов и отчеты месткома управления оросительных систем.