Новосибирское отделение Государственного института по проектированию хлебоприемных, мукомольных, крупяных, комбикормовых предприятий "Промзернопроект" создано приказом Министерства заготовок СССР от 18 февраля 1952 г. Приказом Госкомитета заготовок Совета Министров СССР от 30 сентября 1963 г. отделение реорганизовано в Сибирское зональное отделение Всесоюзного государственного проектного и научно-исследовательского института типового и экспериментального проектирования сельскохозяйственных производственных комплексов и предприятий по хранению и переработке зерна "Гипронисельхоз". Приказом госкомитета от 28 мая 1965 г. вновь создается Новосибирское отделение Промзернопроект. Приказом госкомитета от 19 сентября 1967 г. на базе Новосибирского отделения Промзернопроект и Сибирского зонального проектного и научно-исследовательского института сельского строительства "Гипронисибсельстрой" создан Госниисибпромзернопроект.

Отделение находилось в ведении:

- Министерства заготовок СССР (1952 - 1953, 1953 - 1956);

- Министерства сельского хозяйства и заготовок СССР (1953);

- Министерства промышленности продовольственных товаров СССР (1953);

- Министерства хлебопродуктов СССР (1956 - 1958);

- Госкомитета Совета Министров СССР по хлебопродуктам (1958 - 1961);

- Госкомитета заготовок Совета Министров СССР (1961 - 1963, 1965 - 1967).

Отделение занималось проектированием реконструкции действующих предприятий мукомольно-крупяной промышленности и хлебоприемных пунктов, механизацией и автоматизацией производственных процессов.

Создан приказом Госкомитета заготовок Совета Министров СССР от 19 сентября 1967 г. на базе Новосибирского отделения Промзернопроект и Гипронисибсельстрой.

Институт находился в ведении:

- Госкомитета заготовок Совета Министров СССР (1967 - 1969);

- Министерства заготовок СССР (1969 -).

Институт занимался проектированием предприятий для хранения и переработки зерна.