В начале декабря 1918 г. для руководства борьбой с басмачеством в Фергане был создан областной Ферганский оперативный штаб.

На совместном заседании в г. Скобелеве чрезвычайной комиссии по борьбе с контрреволюцией в Фергане, областного оперативного штаба, военной коллегии, областного исполкома, представителей воинских частей 23 февраля 1919 г. был избран штаб Ферганского фронта. В его состав вошли: областной оперативный штаб, воинская коллегия, представители от воинских частей, областного, уездных и городских исполкомов - с правом решающего голоса, а также военные специалисты - с правом совещательного голоса. Руководил штабом президиум во главе с председателем. Штаб фронта подчинялся правительству и Главному штабу Туркестанской республики. Штабу фронта подчинялись отдельные части и местные формирования Ферганской области, в районе боевых действий он являлся высшей военной властью.

В соответствии с постановлением от 8 августа и приказом No.1010 от 11 августа 1919 г. РВС Туркестанской республики был создан РВС Ферганского фронта, которому подчинялся штаб фронта. В отличие от других фронтов Туркестана, в военном управлении Ферганского фронта некоторое время продолжала действовать выборная коллегия из членов штаба

В составе фронта были созданы боевые группы: приказом РВС фронта No.70 от 7 октября 1919 г. - три, а приказом No.142 от 18 ноября 1919 г. - четыре (1-я - в Скобелевском уезде, 2-я - в Кокандском, 3-я - в Андижанском, 4-я - в Намангансхом).

Приказом РВС Туркестанского фронта No.11 от 22 ноября 1919 г., ликвидировавшим все местные фронты Туркестанской республики, войска, действовавшие на территории Ферганской области, были сведены в Ферганскую отдельную сд (с 22 декабря 1919 г. - 2 Туркестанская сд), а РВС фронта становится временно Реввоенсоветом Ферганской дивизии с правом управления областью.

Дислокация штаба - г. Скобелев (ныне Фергана).

 Войска фронта вели борьбу с басмаческими формированиями Иргаша, Мадамин-бека.

Постановления, протоколы заседаний ЦИК, СНК и РВС Туркестанской республики (апр. -дек. 1919), Ферганского оперативного штаба (дек. 1918 -февр. 1919), РВС и штаба Ферганского фронта (март - дек. 1919), Военного совета 2 Туркестанской сд (дек. 1919), штабов боевых районов (март - авг. 1919).

Приказы, распоряжения административно-строевые РВС, войскам и штабов Туркестанской республики, Ферганского фронта (февр. -нояб. 1919), войскам Ферганской области (апр. -авг. 1919), по Ферганской отдельной и 2 Туркестанской сд (дек. 1919 - янв. 1920), политотделов РВС Туркестанской республики и Ферганского фронта (март - дек. 1919), командиров боевых районов (май - нояб. 1919), РВС Закаспийского фронта (авг. -нояб. 1919).

Положения о военном управлении Туркестанской республики, об Управлении и штабе Ферганского и Закаспийского фронтов, инструкции для солдат Красной гвардии и об организации мусульманских частей (июль - нояб. 1919).

Оперативные приказы, приказания командования и штаба Ферганского

фронта (янв. -нояб. 1919), по Ферганской отдельной сд (нояб. -дек. 1919).

Доклады о деятельности штабов фронта и Крестьянской армии (июнь - окт. 1919), положении на фронте и на боевых участках (нояб. 1919), о работе уездных военных отделов и управлений (июнь - авг. 1919).

Донесения, оперативные сводки главкома Туркестанской республики, штабов Туркестанских войск, Ферганского фронта, подчиненных частей (янв. -дек. 1919). Выписки из журнала боевых действий бронепоезда "Роза Люксембург" (нояб. 1919).

Протоколы заседаний Ферганского областного комитета РКП(б) (авг. -сент. 1919), комитета иностранных коммунистов Ферганской области (май - нояб. 1919), общих и партийных собраний штабов фронта и подчиненных частей (февр. 1919-янв. 1920), заседаний культпросветкомиссий политотделов фронта и частей (февр. -июль 1919). Доклады, сводки политкомов частей, сведения, переписка о культурно-просветительной работе в войсках, характеристики партийных коллективов; основные карты, именные списки политработников и коммунистов учреждений и частей фронта (янв. -нояб. 1919). Воззвания ЦИК Туркестанской республики и РВС Ферганского фронта к басмачам (сент. -нояб. 1919).

Переписка по мобилизационным вопросам (1919).

Сведения, переписка о штатном, списочном, наличном составе, состоянии и дислокации частей фронта, сведения о потерях (сент. - дек. 1919).

Сведения о состоянии снабжения войск, переписка об обеспечении частей вооружением, продовольствием, фуражом, инженерным имуществом (1919).

Протоколы совещаний отдела передвижения и транспорта при штабе фронта (апр. -сент. 1919), сведения, переписка о перевозке войск и военных грузов (1919).