Алтайская губернская чрезвычайная комиссия (АлтгубЧК) по борьбе с контрреволюцией, спекуляцией и преступлениями по должности была создана по постановлению Алтайского губернского оргбюро РКП(б) от 26 декабря 1919 г.

Комиссия была наделена чрезвычайными полномочиями, в ее функции входило своевременное обнаружение и пресечение контрреволюционных и антисоветских выступлений.

Алтайская губернская ЧК функционировала до 1922 г., когда была реорганизована в Алтайский губернский отдел Государственного политического управления (ГПУ), в 1923 г. - в Алтайский губернский отдел Объединенного государственного политического управления (ОГПУ).

В 1925-1930 гг. действовали окружные отделы Объединенного государственного политического управления (ОГПУ) по Сибирскому краю, в 1930-1934 гг. - окружные отделы Объединенного государственного политического управления (ОГПУ) по Западно-Сибирскому краю.

В 1937 г. в связи с образованием Алтайского края окружные отделы прекратили свое существование, было создано управление Народного комиссариата внутренних дел (НКВД) по Алтайскому краю. В 1941 г. управление НКВД было переименовано в управление Народного комиссариата государственной безопасности (НКГБ) по Алтайскому краю, в 1946 г. - в управление Министерства государственной безопасности (МГБ) по Алтайскому краю.

В соответствии с Законом СССР от 15 марта 1953 г. в результате централизации Министерства внутренних дел СССР и Министерства государственной безопасности СССР и образования единого Министерства внутренних дел СССР на Алтае функции органов государственной безопасности получило управление внутренних дел Алтайского края. Указом Президиума Верховного Совета СССР от 13 марта 1954 г единое Министерство внутренних дел СССР было снова разукрупнено и на Алтае было образовано управление Комитета государственной безопасности при Совмине СССР по Алтайскому краю. В его задачи входило: обеспечение государственной безопасности страны, раскрытие государственных преступлений и производство по ним предварительного следствия, пограничная охрана.

В соответствии с Указом Президиума Верховного Совета СССР от 5 июля 1978 г. управление КГБ при Совмине СССР по Алтайскому краю было преобразовано в управление Комитета государственной безопасности СССР по Алтайскому краю. В функции управления входили: охрана государственной безопасности страны, борьба со шпионажем, раскрытие и расследование государственных преступлений, охрана государственной границы, принятие мер по охране документов и сведений, составляющих государственную тайну.

Согласно Указам Президента РФ от 24 января 1992 г. N 42, от 21 декабря 1993 г. N 2233, от 23 июня 1995 г N 633 попеременно создавались Министерство безопасности (МБ) Российской Федерации, Федеральная служба контрразведки (ФСК) Российской Федерации, Федеральная служба безопасности (ФСБ) Российской Федерации. В соответствии с этими актами образовывались соответствующие управления по Алтайскому краю. Основными функциями органов безопасности определены: выявление и пресечение разведывательной деятельности иностранных спецслужб, направленной на нанесение ущерба безопасности России; выявление и пресечение фактов терроризма; организация борьбы с организованной преступностью, коррупцией, контрабандой, незаконным оборотом оружия; обеспечение защиты сведений, составляющих государственную тайну; осуществление мер по обеспечению охраны государственной границы.

Фильтрационно-проверочные и трофейные дела на репатриантов - бывших советских военнослужащих, попавших в немецкий плен в годы Великой Отечественной войны или находившихся во вражеском окружении.

Архивно-следственные дела на граждан, привлекавшихся и осуждавшихся в разные годы по ст. 58 УК РСФСР и впоследствии реабилитированных.

Топографические карты мест захоронений военнопленных японцев после Великой Отечественной войны на территории Алтайского края, пофамильные списки военнопленных японцев, содержавшихся и умерших в лагерях для военнопленных на территории края, с указанием сведений о рождении, дате и месте пленения, лагерях содержания, дате смерти (1945-1946 гг.) (Оп. 4. Ед. хр. 1-3).