Постановлением ЦК РКП(б) от 24 марта 1921 г. был образован Штаб начальника отрядов особого назначения при Главном управлении всевобуча Распоряжением Главкома No.8765 от 29 июля 1921 г. Штаб расформировывается, а вместо него создается самостоятельный Штаб частей особого назначения Республики. Во главе стоял командующий, который через Штаб ЧОН и местные штабы осуществлял командование, руководство формированием, комплектованием, обучением и снабжением частей особого назначения в Республике. Политическое руководство деятельностью Штаба и частей особого назначения осуществлял Совет ЧОН при ЦК РКП(б), в который входили секретарь ЦК РКП(б), комиссар Штаба РККА, представитель ВЧК и командование ЧОН.

На основании приказов РВС СССР No.448/97 от 30 марта и No.785/139a от 14 июня 1924 г. расформирован, функции переданы Главному управлению РККА,

Приказы, циркуляры командующего ЧОН Республики, по ЧОН округов, губерний, фронтов (1922 - 1923).

Положения о советах ЧОН, штабах ЧОН РСФСР и других республик, округов, фронтов, армий, штаты штабов, частей.

Постановления, протоколы заседаний советов ЧОН республик, округов, губерний, комиссии по отрядам особого назначения РСФСР (1922 - 1923).

Отчеты, доклады, донесения об организации, укомплектовании, деятельности советов, штабов и частей особого назначения, о боевой подготовке ЧОН, проведении военных игр и лагерных сборов, подготовке военных специалистов, программы обучения.

Переписка о мобилизации коммунистов в ЧОН.

Сведения, переписка о численном составе, дислокации, вооружении, материальном обеспечении ЧОН республик, округов, фронтов.

Протоколы заседаний комиссии по борьбе с бандитизмом в РСФСР. Оперативные приказы по ЧОН республик, округов, губерний, фронтов, армий; доклады, донесения командующих и начальников штабов ЧОН, оперативные и разведывательные сводки, журналы боевых действий, переписка о боевой деятельности ЧОН, ходе ликвидации бандитизма и антисоветских выступлений, в том числе в Карелии, Поволжье, Сибири (1921 - 1922).

Боевые расписания и сведения о силах и передвижениях банд на территории округов. Документы, захваченные у противника (приказы, обращения, воззвания).