Армия образована приказом РВСР No.3/2 от 11 сентября 1918 г. в составе Северного фронта. На ее формирование обращались войска Северо-Восточного участка отрядов завесы.

В армии продолжало сохраняться введенное в августе 1918 г. разделение войск бывш. Северо-Восточного участка отрядов завесы на районы: Архангельский, Котлассхий, Вятский. Приказом войскам армии No.455/4 от 27 сентября 1918 г. был образован Вельский (впосл. Вельско-Шенкурский) район. Приказом войскам армии No.438 от 26 ноября 1918 г. и No.7 от 12 января 1919 г. из войск Архангельского, Вельского (частично) и Котласского районов были сформированы 18 сд и Печорский отряд. Оставшиеся части Вельско-Шенкурского района объединялись в Шенкурский район, обращенный на укомплектование 2 сбр 18 сд (приказ войскам армии No.104 от 22 мая 1919 г.). Части Вятского района приказом войскам 6 армии No.315 от 3 ноября 1918 г. были переданы 2 армии Восточного фронта.

В связи с ликвидацией Северного фронта (директива Главкома No.795/ш от 12 февраля 1919 г.) 6 армия подчинялась непосредственно Главкому и получила наименование 6 Отдельной.

Директивой Главкома No.3610/оп от 2 августа 1919 г. в состав армии передавался Междуозерный участок Западного фронта.

В армии для оперативного управления войсками создавались боевые районы: Северо-Двинский (апр. 1919 - март 1920), Двинско-Мезенский (янв. -февр. 1919), Пинего-Печорский (февр. -авг. 1919).

В оперативном подчинении армии находились Северо-Двинская речная (сент. 1918 - май 1920), Онежская озерно-речная (авг. 1919 - апр. 1920) флотилии.

Приказом РВСР No.601/104 от 10 апреля 1920 г. армия была расформирована, ее управление переформировывалось в окружной комиссариат Беломорского военного округа, войска передавались в состав округа и 7 армии.

Дислокация штаба: гг. Вологда (сент. 1918 - февр. 1920), Архангельск (март - апр. 1920).

 Войска армии действовали против интервентов и белогвардейцев на направлениях, ведущих от Архангельска на Вологду и по р. Северная Двина на Котлас и Вятку (сент. -дек. 1918) с целью не допустить их соединения

 с противником, действующим на Восточном фронте; провели Шенкурскую операцию (19 - 25 янв. 1919), вели бои по освобождению линии ж.д. Вологда - Архангельск, течения рек Северная Двина, Печора, Пинега, Мезень (апр. - нояб. 1919), осуществили операции по освобождению гг. Архангельск, Онега, Пинега (февр. 1920), Мурманск и Мурманской ж.д. (март 1920); охраняли границу с Финляндией.

Приказы, приказания административно-строевые войскам, по штабу (авг. 1918 - апр. 1920), политотделу (апр. 1919 - янв. 1920) армии, по управлениям: военного инспектора (авг. 1918 - июль 1919), инспекторов пехоты (янв. 1919 -февр. 1920) и артиллерии (авг. 1918 - июль 1920), начальников: военных сообщений (окт. 1918 - май 1920), инженеров (нояб. 1918 - апр. 1920), связи, авиации (окт. 1918 - июнь 1920), по авиачастям (сент. -дек. 1918), по управлениям артиллерийского, инженерного, интендантского снабжения (авг. 1918 - апр. 1920), санитарной части (авг. 1918 - апр. 1920); по политическому отделению Пинего-Печорского района (апр. -окт. 1919), по управлению военными транспортами Двинско-Мезенского и Пинего-Печорского районов (нояб. 1918 - сент. 1919).

Оперативные приказы, приказания командования армии, боевых районов, распоряжения штаба армии (авг. 1918 - апр. 1920), по 18 сд (нояб. 1918 - март 1919).

Записи разговоров по прямому проводу командования армии с командующими боевыми районами, соединениями и частями (авг. 1918 - апр. 1920) по оперативным вопросам.

Оперативные сводки штабов армии, боевых районов, подчиненных частей (авг. 1918 - апр. 1920), соседних фронтов. Журналы боевых действий армии (авг. 1918 - окт. 1919).

Карты и схемы расположения войск армии (1918 - 1920).

Материалы о деятельности и состоянии речных и озерных флотилий армии (1918 - 1920).

Материалы (приказы, распоряжения, сводки, переписка) по подавлению восстания "зеленых" в Грязовецком и Пошехонском уездах (июль - авг. 1919).

Разведывательные сводки штабов армии, подчиненных войск, соседних фронтов и армий (сент. 1918 - март 1920); сведения о боевом и численном составе войск (авг. -окт. 1918), морских и речных сил противника (март - июнь 1919); опросные листы пленных и перебежчиков (сент. 1918 - янв. 1920).

Доклады, политсводки политотдела армии, политотделений боевых районов, донесения, рапорты военкомов соединений и частей, переписка об агитационно-пропагандистской и культурно-просветительной работе и настроении в войсках и среди местного населения (окт. 1918 - июнь 1920). Переписка РВС армии с центральными военными управлениями, соединениями и частями, сведения об агитационной работе в войсках противника

(февр. -дек. 1919), о ведении переговоров с командованием английских войск по обмену военнопленными (февр. -май 1919). Анкеты, личные карточки, именные списки коммунистов и политработников (дек. 1918 - март 1920).

Переписка с местными органами власти, штабами фронта, соединений о ходе мобилизации населения, формировании и укомплектовании частей; сведения о боевом, штатном, списочном составе и дислокации частей и соединений армии, потерях личного состава и трофеях (июль 1918 - май 1920).

Описания путей сообщения в районе действий армии (окт. 1918 - май 1919), рабочие планы и чертежи по ремонту участков Северной ж.д. Доклады, донесения о протяженности и состоянии военных дорог (май 1919 - апр. 1920), о ходе строительства линий железных дорог Котлас-Сельцо (июнь - окт. 1919), Грязовец-Вологда-Тотьма (июнь - дек. 1919), о состоянии и работе транспортов (янв. - март 1920), мобилизации гужевого транспорта.

Доклады, рапорты о строительстве оборонительных сооружений вокруг Петрограда (февр. -дек. 1918), укреплении инженерных позиций Северо-Восточного участка отрядов завесы (авг. - нояб. 1918), создании минных заграждений на рр. Онега, Северная Двина, Вага (янв. 1918 - июль 1919), схема обороны г. Вологды.

Донесения, переписка о состоянии и техническом оборудовании радиостанций; схемы радиосвязи, телеграфной и телефонной связи армии (1918 - 1920).

Записи разговоров по прямому проводу начальника авиации с командирами авиачастей, переписка о состоянии частей (янв. 1918 - дек. 1919), о результатах авиаразведки в тылу противника (нояб. 1918); журналы и ведомости учета боевых вылетов (сент. 1918 - март 1920).

Сведения, переписка об артиллерийском, инженерном и интендантском снабжении войск (авг. 1918 - апр. 1920).

Доклады о состоянии и деятельности санитарных частей и учреждений (нояб. 1918 - апр. 1920), протоколы заседаний чрезвычайного съезда по борьбе с сыпным тифом в армии (янв. -апр. 1920); доклады о деятельности учреждений Красного Креста при армии (1918 - 1920).